黏液物质染色有多种方法，如AB-PAS染色、黏液HID-AB染色、标准阿利新蓝染色等。以上方法大多是利用阿利新蓝(Alcian)等阳离子染料可与酸性基团结合，也即阿利新蓝与组织内含有的阴离子基团如羧基和硫酸根形成不溶性复合物这一原理。

改良Hale胶体铁黏多糖染色液的染色原理是胶体铁粒子在酸性条件下可以和酸性粘液物质紧密结合形成不溶性复合物，然后利用普鲁士蓝反应使酸性黏多糖呈现蓝色。本法较阿利新蓝法着色更深且不易被洗脱。常用于诊断肾嫌色细胞癌及大鼠上皮细胞中酸性黏多糖物质。