细胞学常规染色普遍使用巴氏(Papanicolaou)法，Papanicolaou Stain初期仅用于检测阴道上皮雌激素水平以及生殖道念珠菌、滴虫等病原体，橘黄G6与EA36或EA50联合使用，可将胞浆染成颜色鲜明的绿色、蓝色和粉色。目前大多数实验室采用成品染液，所以每种染液应注意其改良后的适宜条件，胞浆染色应透明可见，核染色质应很容易辨别出来。目前改良的巴氏染色液含有多种离子，具有多色性染色效能，染色后胞质鲜艳、透明性好以及核膜、核仁、染色质结构清晰。细胞核染色液主要为Harris苏木素染液，细胞质染色液主要为EA36染液、EA50染液；巴氏染色液用于细胞脱落标本，细胞核呈蓝色或黑色，角化鳞状细胞胞浆呈粉红或橘红色。

巴氏染色液细胞质染液采用EA36染色液，细胞核染色采用苏木素染色液，EA36比EA50更适用于妇科细胞学涂片染色如筛查宫颈癌和癌前病变。