结晶紫是一种可以和细胞核中的DNA结合的碱性染料，对细胞核染色，三苯甲烷染料和甲基紫是用于验证淀粉样物的人工合成染料。甲基紫是四、五、六甲基副品红碱的混合物，淀粉样物的染色可能是由于甲基紫选择性地对某种有色成分具有亲和力，淀粉样物的反应还远远不是特异性的，因为缺乏同其他组织成分区分的显著的颜色变化，甲基紫染色切片采用水溶性封固剂封固是很必要的，因为局部的脱水作用会破坏红色的多染性。

结晶紫-柠檬酸染色液(0.1%)主要由结晶紫、柠檬酸等组成，是一种组织或细胞染色时常用的可以把细胞核染成深紫色的染色液。