潘氏细胞位于肠腺的基底部，形态和肠上皮细胞相似，呈锥体形，常三、五成群，互相并列。细胞核为椭圆形，位于细胞基部，胞浆内含有粗大的嗜酸性颗粒，故HE染色切片被染为红色。在潘氏细胞颗粒中含有金属锌、精氨酸和酪氨酸。有人用免疫细胞化学方法测定其分泌颗粒内含有溶酶菌，溶酶菌能消化某些细菌，对控制肠内细菌有着一定作用，但有关潘氏细胞的功能尚不完全清楚。

潘氏细胞染色液采用Lendrum法，又称荧光桃红-酒石黄法，利用荧光桃红将潘氏细胞染成红色，细胞核染成蓝色，背景被酒石黄复染为黄色。此法除进行潘氏细胞染色外，还可用来显示病毒包涵体。