卡氏肺囊虫(penumocystis carinii)为Carinii于1910年在大鼠肺中发现，1912年由Delanoe夫妇再次在大鼠肺内发现本虫，因而定名为卡氏肺囊虫，目前多数学者认为该虫为原虫，其生活史是在肺泡里完成的，成熟的包囊为圆形或椭圆形，直径约5~10μm，外围有囊壁，内含8个囊内小体，小体约1~2μm，呈半月形。卡氏肺囊虫多为合并感染引起的，当免疫力低下时容易被感染肺囊虫性肺炎，HE染色时不宜识别卡氏肺囊虫，仅可见肺泡腔内囊虫呈浅嗜酸性小颗粒，常被误诊为渗出液中的蛋白，目前可用特殊染色法显示卡氏肺囊虫，比较容易识别，常见的方法有六胺银法、荧光桃红-酒石黄法、PAS法和Gram法等，以前三种方法为佳。