横纹肌肿瘤

梭形细胞横纹肌肉瘤中可发生SRF-NCOA2和TEAD1-NCOA2融合基因，NCOA2基因断裂探针有助于这类肿瘤的鉴别诊断；
应用于软组织血管纤维瘤（Softtissueangiofibroma）；
软组织血管纤维瘤有重现性融合基因AHRR-NCOA2和GTF2I-NCOA2；

设计为NCOA2基因断裂探针用于辅助诊断；

软组织骨性-软骨性肿瘤和瘤样病变

应用于软组织血管纤维瘤（Soft tissue angiofibroma），软组织血管纤维瘤有重现性融合基因AHRR-NCOA2和GTF2I-NCOA2，设计为NCOA2基因断裂探针用于辅助诊断。

HEY1-NCOA2基因融合表现为mRNA水平上HEY1外显子4与NCOA2外显子13的框内融合，HEY1和NCOA2分别定位于8q21.1和8q13.3，间隔10 Mb左右。因此对FISH检测结果的判读应十分小心。该基因融合发生在几乎所有间叶软骨肉瘤，在软骨肉瘤的其他亚型中不存在，有较高特异性，可用于间叶软骨肉瘤的诊断和鉴别诊断。

注意：在间叶软骨肉瘤中NCOA2基因可与HEY1融合，可用PCR+测序法检测。但不能用FISH法检测，因为两者在基因组中相距仅有8M，不易区分阴/阳性信号，可能导致误判。间叶软骨肉瘤小活检时仅见到圆细胞成分时，需与小细胞骨肉瘤、尤文肉瘤和其他为分化圆细胞肉瘤鉴别。